Présentation :

  • 24 capillaires
  • Principe d’électrophorèse capillaire
  • Camera de détection DDC
  • Trois types d’analyses Séquençage, Génotypage et HID (human identification).

 

 

 

 

 

 

Types d’analyses :

1.Séquençage

  • Principe de la méthode de Sanger
  • Séquençage des fragments ≥ 850 pb
  • Se déroule en plusieurs étapes :

1.1.PCR
1.2.Purification des produits PCR facultative
1.3.Réaction de séquençage

2.Génotypage (Analyse de fragment)

Des marqueurs moléculaires: SNP, Microssatellites, RFLP ……

Etapes

1. PCR

Amorces doivent être marquées par l’un des flurophores suivant : 6-FAMTM dye, VIC® dye, NEDTM dye et PET® dye

2. Dénaturation à 95°C / min 5

ADN + Marqueur de taille (600 liz, …)

Publications les plus récentes utilisant le Génétique Analyzer 3500 xl

[1] J.-P. Han, F. Yang, C. Xu, Y.-L. Wei, X.-C. Zhao, L. Hu, J. Ye, and C.-X. Li, “A new strategy for sperm isolation and STR typing from multi-donor sperm mixtures,” Forensic Sci. Int. Genet., vol. 13, pp. 239–246, 2014.
[2] A. E. Pen, M. Nyegaard, M. Fang, H. Jiang, R. Christensen, H. Mølgaard, H. Andersen, B. P. Ulhøi, J. R. Østergaard, S. Væth, M. Sommerlund, A. P. M. de Brouwer, X. Zhang, and U. B. Jensen, “A novel single nucleotide splice site mutation in FHL1 confirms an Emery-Dreifuss plus phenotype with pulmonary artery hypoplasia and facial dysmorphology,” Eur. J. Med. Genet., vol. 58, no. 4, pp. 222–229, 2015.
[3] M. H. Afrad, P. C. Karmakar, S. K. Das, J. Matthijnssens, F. Ahmed, S. Nahar, a. S. G. Faruque, M. Z. Rahman, M. Rahman, and T. Azim, “Epidemiology and genetic diversity of human astrovirus infection among hospitalized patients with acute diarrhea in Bangladesh from 2010 to 2012,” J. Clin. Virol., vol. 58, no. 4, pp. 612–618, 2013.
[4] A. O. Achieng, P. Muiruri, L. a. Ingasia, B. H. Opot, D. W. Juma, R. Yeda, B. S. Ngalah, B. R. Ogutu, B. Andagalu, H. M. Akala, and E. Kamau, “Temporal trends in prevalence of Plasmodium falciparum molecular markers selected for by artemether–lumefantrine treatment in pre-ACT and post-ACT parasites in western Kenya,” Int. J. Parasitol. Drugs Drug Resist., vol. 5, no. 3, pp. 92–99, 2015.
[5] M. H. Afrad, J. Matthijnssens, S. Moni, F. Kabir, A. Ashrafi, M. Z. Rahman, A. S. G. Faruque, T. Azim, and M. Rahman, “Genetic characterization of a rare bovine-like human VP4 mono-reassortant G6P[8] rotavirus strain detected from an infant in Bangladesh,” Infect. Genet. Evol., vol. 19, pp. 120–126, 2013.
[6] I. M. Sulaiman, Y. Ortega, S. Simpson, and K. Kerdahi, “Genetic characterization of human-pathogenic Cyclospora cayetanensis parasites from three endemic regions at the 18S ribosomal RNA locus,” Infect. Genet. Evol., vol. 22, pp. 229–234, 2014.
[7] K. B. Gettings, K. M. Kiesler, and P. M. Vallone, “Performance of a next generation sequencing SNP assay on degraded DNA,” Forensic Sci. Int. Genet., vol. 19, pp. 1–9, 2015.